Patent WO03104388
(Filed 2002-06-06, Issued 2003-12-18):
Martin Jambon, Gilbert Deléage and Christophe Geourjon.
Process for identifying similar
3D substructures onto 3D atomic structures and its applications.
Articles
Friedberg I, Jambon M, Godzik A.
New avenues in protein function prediction.
Protein Sci. 2006 Jun;15(6):1527-9.
[pdf]
Jambon M, Andrieu O, Combet C, Deleage G, Delfaud F, Geourjon C.
The SuMo server: 3D search for protein functional sites.
Bioinformatics. 2005 Sep 1; 21(20):39293930.
[pdf]
Jambon, M. and Imberty, A. and Deleage, G. and
Geourjon, C.
A new bioinformatic approach to detect common 3D
sites in protein structures.
Proteins
2003 Aug 1; 52(2):137-45.
[pdf]
Lalle P, Aouacheria A, Dumont-Miscopein A, Jambon M,
Venet S, Bobichon H, Colas P, Deleage G, Geourjon C, Gillet G.
Evidence for crucial electrostatic interactions between
BCL-2 homology domains BH3 and BH4 in the anti-apoptotic NR-13
protein.
Biochem J
2002 Nov 15; 368(Pt 1):213-21.
[pdf]
Combet C, Jambon M, Deleage G, Geourjon C.
Geno3D: automatic comparative molecular modelling of protein.
Bioinformatics.
2002 Jan; 18(1):213-4.
[pdf]
Other
Communication:
Iddo Friedberg, Martin Jambon, Andrei Osterman
and Adam Godzik. A ``Fair and Balanced'' Assessment of Protein Function
Prediction Servers. June 2005. Automated function
prediction SIG, International Conference on Intelligent Systems in
Molecular Biology (ISMB 2005), Detroit, Michigan.
Communication:
Martin Jambon. SuMo: structure comparison of proteins focused on
functional properties of ligand binding sites.
June 2005. Automated function
prediction SIG, ISMB 2005, Detroit, Michigan.
Poster:
Martin Jambon, Christophe Geourjon, François Delfaud.
Unification of discrete and continuous effects on protein
interfaces: an extension of the concept of hydrophobic effect and its
application. June 2005. ISMB 2005, Detroit, Michigan.
Communication (1 hour):
Martin Jambon,
Un système de prédiction de sites fonctionnels dans
les structures 3D de protéines.
Seminar for Hybrigenics,
Paris, France, June 2002
Communication (20 min):
Martin Jambon, Anne Imberty, Gilbert Deléage, Christophe Geourjon,
SuMo: a software that detects 3D sites shared by protein structures.
JOBIM 2002 (Journées ouvertes biologie informatique
mathématiques),
Saint Malo, France,
12 June 2002
Poster:
Martin Jambon,
SuMo : logiciel intégré de caractérisation de sites
actifs de protéines au service du drug design.
9ème carrefours de la fondation Rhône-Alpes Futur,
Lyon, France,
17 November 2001
Communication (30 min):
Martin Jambon,
SuMo, une méthode
de comparaison des propriétés de surface des protéines.
Séminaire de "Bio-Informatique Structurale",
Montpellier, France,
4 October 2001
Communication (20 min):
Martin Jambon,
SuMo, une méthode
de comparaison des propriétés de surface des protéines.
5ème journée de l'EDISS (Ecole doctorale),
Lyon, France,
29 May 2001
Poster:
Christophe Combet, Martin Jambon, Gilbert Deléage et Christophe
Geourjon,
Geno3D un serveur Web automatique de modélisation
moléculaire,
presented in
12e rencontres du GGMM (groupe de
graphisme et modélisation moléculaire),
Nîmes, France,
9-11 May 2001
Communication (20 min):
Martin Jambon, Christophe Combet, Gilbert Deléage et
Christophe Geourjon,
SuMo, une méthode
de comparaison des propriétés de surface des protéines.
12e rencontres du GGMM (groupe de
graphisme et modélisation moléculaire),
Nîmes, France,
9-11 May 2001
Poster:
Martin Jambon, Mounir Errami, Gilbert Deléage and
Christophe Geourjon.
Development of the SuMo method to detect 3D sites in
proteins.
Presented in
12e rencontres du GGMM (groupe de
graphisme et modélisation moléculaire),
Nîmes, France,
9-11 May 2001
Summer school on protein folding,
Cargèse, France,
20-26 May 2001
5ème journée de l'EDISS (Ecole doctorale),
Lyon, France,
29 May 2001
JOBIM 2001 (Journées ouvertes biologie informatique
mathématiques)
Toulouse, France,
30 May-1 June 2001